生活饮卫生标准GB 5749-2022 规定的常规检验微生物指标共3项，总大肠菌群、大肠埃希氏菌、菌落总数。其中水中菌落总数可作为评价水质清洁程度和考核净化效果；大肠菌群指示水体是否存在肠道传染病的可能性。作为粪便污染的指示菌，大肠埃希氏菌检出的意义最大，其次是粪大肠菌群，总大肠菌群的卫生学意义稍逊一些。
水质微生物检测依据
GB/T 5750.2-2023《生活饮用水标准检验方法 第2部分：水样的采集与保存》
GB/T 5750.12-2023《生活饮用水标准检验方法 第12部分：微生物指标》
水质微生物检测水样采集方法
一、采样容器
洁净磨口硬质玻璃瓶；洁净聚乙烯瓶（桶或袋）
二、采样容器的洗涤
1.容器洗涤：将容器用自来水和洗涤剂洗涤，并用自来水彻底冲洗后用质量分数为10%的硝酸（或盐酸）浸泡8h以上，然后依次用自来水和纯水洗净。
2.容器灭菌：可采用干热或高压蒸汽灭菌两种。干热灭菌要求160℃下维持2h；高压蒸汽灭菌要求121℃下维持15min，高压蒸汽灭菌后的容器如不立即使用，应置于60℃烘箱内将瓶内冷凝水烘干。灭菌后的容器应在2周内使用。
三、水质微生物检测采样要求
1.无菌操作。
2.不应用水样荡洗已灭菌的采样瓶或采样袋 。
3.避免手指和其他物品对瓶口或袋口的玷污。
4.自来水水样：先将水龙头用火焰烧灼3min灭菌再开放水龙头使水流5min（经常用水的水龙头放水1-3min）后，采集微生物水样。
5.水源水水样：选有代表性的地点及可疑地方，一般距水面下10-15cm采集，采样后在水中盖好盖子，再从水中取出。
6.从速送检，在0~4℃下保存，微生物水样从采集到检验不应超过8h。
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